Az USA tudományos köreiben régóta terjed a
következő vicc: „Kérdés: mi jellemzi országunk elitegyetemeit?
Válasz: hogy ott amerikai pénzből orosz tanárok oktatnak kínai
diákokat.” Nehéz volna megmondani, hogy e vélekedésnek mennyi a
valós ténybeli alapja, de az a külföldi érdeklődő számára is
nyilvánvaló, hogy az élenjáró tudományos műhelyekből származó
legkiválóbb közlemények szerzői között szinte mindig van – a neve
alapján – kínainak tekinthető személy. Ezek egyikéről szól ez a
cikk. Ahhoz azonban, hogy választott hősünk, Feng Zhang
teljesítményét méltassuk, kell egy kis kerülőt tennünk.
Minden év októberének közeledtével (ekkor hozzák
nyilvánosságra a Nobel-díjasok személyét), de többnyire már korábban
is, megtelnek a tudományos és tudománynépszerűsítő magazinok, sőt a
tömegkommunikáció médiumai is a találgatásokkal, jóslásokkal arról,
ki lesz majd a legjelentősebb tudományos díj nyertese. Ezek az
augurok már két éve egyre gyakrabban emlegetnek az orvosi-biológiai
(vagy esetleg a kémiai) díj esélyesei között két egymástól
független, de szinte egyformán alapvetően fontos, már eddig is
sikeresnek bizonyult és még több új lehetőséget megnyitó
felfedezést. E sorok írójának is az a véleménye, hogy előbb-utóbb
szinte biztosan mindkettő meg fogja kapni ezt a legmagasabb
elismerést. E két felfedezés rövid neve: optogenetika, illetve
CRISPR-cas9 genommódosítás.
Noha e két új eredmény jelentősége vitathatatlan,
az nyilván még nagy fejtörést fog okozni a Nobel-díj bizottság
számára, hogy – figyelembe véve a szigorú szabályt, miszerint egy
tudományterületen háromnál több személy között nem osztható meg a
díj – ki legyen a (legfeljebb) három kiválasztott nyertes.
Tekintettel arra, hogy még a legújszerűbb felfedezéseknek is vannak
fontos történeti előzményei, hogy olykor nagy létszámú csapatok
közös érdeme az eredmény, továbbá hogy a felfedezés sokszor teljesen
párhuzamosan születik meg két vagy több műhelyben, ez a kiválasztás
szinte mindig problematikus, és gyakran vezet későbbi vitákhoz,
konfliktusokhoz. Ennek egyik következménye esetleg az lehet, hogy ha
mindkét említett felfedezés meg is kapja a díjat, a díjazottak
között nem lesz ott az az egyetlen személy, akinek mindkét eredmény
megszületésében alapvetően fontos része volt: Feng Zhang.
Zhang Kínában született 1982-ben, és tizenegy éves
volt, amikor édesanyjával az USA-ba emigráltak. Az iowai Des
Moines-ben járt középiskolába, ahol korán kitűnt tehetségével. Már
tizenhét évesen, érettségi előtt elkezdte a tudományos kutatást a
Massachussetsi Műegyetemen (MIT) és a következő évben az INTEL által
kiírt tudományos tehetségkutató versenyen harmadik díjat nyert. BSc.
diplomáját kémia–fizika szakon a Harvardon kapta meg 2004-ben, majd
a Stanfordon doktorált 2009-ben kémia–biomérnökség szakon. Itt
szakmai vezetője az a Karl Deisseroth volt, akivel közösen jegyezték
az optogenetika minden bizonnyal legfontosabb cikkét (Boyden et al.,
2005). Ennek köszönhető a 2012-es Perl-UNC Neuroscience Prize,
amelyet mesterével, Deisseroth-tal és szintén ifjú kollégájával,
Edward Boydennel együtt nyert el. Elsősorban ennek az eredménynek
tudható be, hogy 2014-ben megkapta a fiatal kutatók (35 év alatt)
számára elérhető legmagasabb amerikai tudományos elismerést, a
Nemzeti Tudományos Alap (NSF) díját is. Zhang 2011-ben önálló
kutatócsoportot alapított az MIT-hoz tartozó Broad Institute-ban, és
itt fordult érdeklődése a genomszerkesztésre alkalmas új módszer, a
CRISPR-cas9 felé. Az ő laboratóriuma publikálta 2013-ban azt az
alapvetően fontos közleményt, amelyben beszámolnak a módszer
emlőssejtekben (azaz elvileg emberben is) való alkalmazhatóságáról
(Cong et al., 2013). Erre a cikkre a következő három évben több mint
huszonötezren hivatkoztak. Minthogy az ebben a munkában alkalmazott
technológia alapjait Jennifer Doudna és Emmanuelle Charpentier 2012
nyarán megjelent közleménye fektette le (Jinek et al., 2012), ennek
alapján kapták ők hárman együttesen (azaz Zhang, Doudna és
Charpentier) 2014-ben a Jacob Heskel Gabbay-díjat. Az együttes
elismerés azonban nem jelenti azt, hogy a három kitüntetett
puszipajtássá vált. Közben ugyanis szabadalmi háború bontakozott ki
a szerzők intézményei között, sokak szerint minden idők egyik
legértékesebb találmánya körül (a kommentárok olykor milliárd
dolláros nagyságrendű tétről írnak). Zhang ugyanis (egyedül),
illetve az őt foglalkoztató Broad Institute 2013-ban szabadalmi
bejelentést tett a technológiára, jegyzőkönyvei bemutatásával
igazolva, hogy az ő ötlete már 2011-ben megszületett. Ezt az igényt
támadta meg a Doudnát foglalkoztató Kaliforniai Egyetem és a hozzá
csatlakozó (akkor Charpentiert foglalkoztató) Bécsi Egyetem azzal,
hogy az elsőbbség vitathatatlanul Doudnát és Charpentiert illeti
meg, hiszen ők Zhangnál korábban, már 2012-ben publikálták a
módszert. Ez a jogvita nyilván sokáig fog tartani és igen sok
pénzébe fog kerülni a harcoló intézményeknek, sőt az is lehetséges,
hogy befolyásolja majd a Nobel-díj bizottság esetleges döntését. Az
azonban ettől független tény, hogy Zhang tovább dolgozott a
módszeren, és 2015-ben publikált új eredményei úgy tűnik,
kiküszöbölhetik a technológia legnagyobb hiányosságát, és ezzel
megnyithatják az utat a majdani humán alkalmazás előtt (Zetsche et
al., 2015).
Ezután a bevezetés után az olvasó feltehetően
szeretné megismerni a két felfedezés lényegét és jelentőségét is.
Lássuk tehát először az optogenetikát, amit 2010-ben a Nature az „Év
módszerének”, a Science „Az évtized áttörésének” nevezett. Azt az
agykutatói díjat (Brain Prize), amelyet első ízben 2011-ben magyar
tudósok (Buzsáki György, Somogyi Péter és Freund Tamás) nyertek el,
2013-ban az optogenetika felfedezéséért ítélték oda hat kutatónak
(Ernst Bamberg, Peter Hegemann, Gero Miesenböck, Georg Nagel, Edward
Boyden és Karl Deisseroth. Deisseroth fiatal munkatársa, Zhang ebből
a díjból kimaradt, valószínűleg igazságtalanul, feltehetően azért,
mert már a hat díjazottat is sokallották, és Zhang csak
doktoranduszként vett részt a munkában).
Az optogenetika történetét talán a legidősebb
díjazottnál, Ernst Bamberg frankfurti biofizikus professzornál kell
kezdeni. Ő ismerte fel, hogy egy algából izolált fehérje
(csatornarodopszin2) két érdekes tulajdonsággal rendelkezik,
fényérzékeny és amellett ioncsatorna, azaz fény hatására megváltozik
az a képessége, hogy biológiai membránba építve elősegíti kationok
átjutását a membránon (Nagel et al., 2003). Ebből a felismerésből
kiindulva, korábbi munkatársa, Georg Nagel és mások beépítették a
csatornarodopszint kódoló gént a Caenorhabditis elegans nevű kis
féregbe, és így a féreg viselkedésében fény hatására jellegzetes
változást tudtak előidézni (Nagel et al., 2005). Ezekkel az
eredményekkel többé-kevésbé párhuzamosan Gero Miesenböck osztrák
kutató New Yorkban (jelenleg Oxfordban dolgozik) muslica
(Drosophila) rodopszin génjét vitte be emlős szövetkultúra sejtekbe,
és ott hasonló jelenségeket tudott előidézni (Zemelman et al.,
2003). A nagy áttörést azonban Deisseroth, Boyden és Zhang 2005-ben
megjelent közleménye jelentette (Boyden et al., 2005), amelyben
arról számoltak be, hogy a csatornarodopszin2 génjét egér
idegsejtekbe vitték be. Ezzel olyan kísérleti rendszert hoztak
létre, amelyben egy magasabbrendű (emlős) állatban specifikus
idegpályák működését, és ezáltal az állat viselkedését lehetett
irányítottan befolyásolni minden invaziv beavatkozás nélkül, pusztán
fénysugárral. Azóta az optogenetika a neurobiológiai kutatás egyik
legfontosabb eszközévé vált, hazánkban például Acsády László ért el
vele izgalmas alapkutatási eredményeket. Az is valószínűsíthető,
hogy ez a technológia közelebb fog vinni a Parkinson-kór, az
autizmus, a skizofrénia, a depresszió vagy a szorongás
mechanizmusainak megismeréséhez, és ezáltal jövőbeni gyógyítási
lehetőségéhez is.
A CRISPR-cas9 módszer története még régebbre
vezethető vissza. 1987-ben közölték japán kutatók, hogy a
molekuláris biológusok kedvenc baktériuma, az Escherichia coli
DNS-ében van egy ismétlődő, sajátos szekvenciaelem, amelynek
ismeretlen a szerepe (Ishino et al., 1987). Ez a cikk gyakorlatilag
visszhangtalanul süllyedt el a jelentéktelen tudományos közlemények
tengerében. Annak sem lett sokkal nagyobb hatása, amikor egy
obskurus egyetem (a spanyolországi Alicantében) fiatal
doktorandusza, Francisco Mojica egy obskurus baktériumban (Haloferax
mediterranei) leírt egy ehhez hasonló szekvenciát, sőt meg is
sejtette annak lehetséges funkcióját, és ő nevezte el CRISPR-nek (a
betűszó a clustered regularly interspersed palindromic repeats, azaz
halmozottan előforduló, szabályos közökkel elválasztott
palindromikus ismétlődések rövidítése) (Mojica et al., 1995). Az
ezután következő két fontos fejlemény alkalmazott kutatóhelyekhez
fűződik. Gilles Vergnaud francia genetikus a hadügyminisztériumtól
kapott megbízást patogén mikroorganizmusok kutatására azért, hogy a
Szaddam Husszein feltételezett biológiai fegyverei elleni védekezést
segítse. E munka során, elsősorban a pestist okozó Yersinia pestis
különböző törzseinek vizsgálata során megtalálták ugyanezeket az
elemeket, és megerősítve Mojica sejtését leírták, hogy „…a
CRISPR-elemek korábbi genetikai agressziók emléknyomai lehetnek”
(Pourcel et al., 2005). A sejtés bizonyítása a DuPont cég egyik
dániai élelmiszerbiológiai laboratóriumában (Danisco)
|
|
történt meg, ahol azt vizsgálták, hogy hogyan lehet
megvédeni a joghurt- és sajtkészítéshez használt tejsavbaktériumot
(Streptococcus termophilus) a gyakori fágfertőzéssel szemben. Ez a
csoport (amelynek vezetője egy feltehetően magyar származású francia
mikrobiológus, Philippe Horvath volt) kimutatta, hogy ha egy
fág-DNS-ből származó szekvenciaelemet mesterségesen beépítenek a
baktérium CRISPR-elemébe, az ismétlődő szekvenciák közé, az védelmet
nyújt a fág további támadása ellen (Barrangou et al., 2007). Ezzel
megerősítették a korábbi feltételezést, amely szerint a természetes
védelem úgy jött létre, hogy a fágfertőzéskor a fág-DNS bizonyos
töredéke beépült a CRISPR-régióba, és jelenléte biztosította az
újabb fertőzéssel szembeni védelmet. Azaz a rendszer többé-kevésbé
úgy működik, mint a magasabbrendű élőlények immunrendszere. Azt is
megállapították, hogy ehhez az „immunválaszhoz” szükség van a
baktérium egy cas9-nek elnevezett fehérjéjére. A rendszer biológiai
funkciója tehát immár ismert volt, de működési mechanizmusa még nem.
Ekkor azonban már az ügy az érdeklődés középpontjába került, és
egymás után születtek meg (olykor párhuzamosan) a jelentős új
eredmények. A legfontosabb talán annak a felismerése volt (ez
elsősorban Emmanuelle Charpentier érdeme), hogy a baktériumsejtekben
jelentős mennyiségben képződik egy RNS-molekula, amelyet a
CRISPR-régió melletti genomszakasz kódol, és amelynek egy huszonöt
nukleotid hosszúságú szakasza komplementer szerkezetű a CRISPR-régió
ismétlődő szekvenciájával (Deltcheva et al., 2011). A másik fontos
felismerés az volt, hogy a cas9 fehérje egy DNS-bontó enzim
(endonukleáz). A sajátos bakteriális immunrendszer működését tehát
úgy kell elképzelnünk, hogy fágfertőzéskor a fág-DNS egy kis
szakasza beépül a baktérium DNS CRISPR régiójának ismétlődő elemei
közé. A CRISPR-régió melleti DNS-szakaszról kiindulva készül egy
olyan RNS-másolat, amely tartalmazza a beépült fág-DNS-ről készült
másolatot is. Ez az RNS több átalakulási lépés után kapcsolódik egy
cas9 elnevezésű DNS-bontó enzimhez. Ez az enzim viszont csak akkor
működik, ha a hozzá kapcsolódott RNS odavezette és kötötte egy
kiegészítő (komplementer) szekvenciájú DNS-hez, ekkor azt képes
elvágni. Minthogy a CRISPR-elemben ott volt a veszélyes fág-DNS egy
szakasza, így az újra támadó fág DNS-ét lebontja a cas9 enzim. Ennek
a működésmódnak a megismerése megnyitotta az utat a rendszer
komponenseinek egy in vitro kísérleti rendszerben történő
összehozásához és ezzel elvben más sejtekben történő működtetéséhez.
Erről szólt Doudna és Charpentier Science-ben 2012 nyarán megjelent
cikke, amelyben a szerzők leírják, hogy „…a rendszer tulajdonságai
kihasználhatók lehetnek RNS által programozott genomszerkesztésre.”
(Jinek et al., 2012). Ezért Doudna és Charpentier elnyerték a
2015-ös Breakthrough Prize-t és a l’Oreal-UNESCO 2016-os Nők a
Tudományban díját.
Ha ugyanis olyan – mesterségesen szintetizált –
RNS-molekulát használnak, amely képes a cas9 enzimmel komplexet
képezni, és egyben tartalmaz egy olyan szekvenciát, amely a genom
tetszőlegesen kiválasztott szakaszával komplementer (ennek neve
guide, azaz vezető RNS), akkor a cas9 ezen a ponton el fogja vágni a
sejt DNS-ét. Az már korábban ismert volt, hogy ilyen DNS-hasítást a
sejt javító mechanizmusai képesek összefoltozni, és ennek
manipulálásával mutációk hozhatók létre. Itt érdemes megjegyezni,
hogy hasonló eredményt ért el Virginijus Siksnys litván kutató is,
de az ő cikkét a Cell (lektorálás nélkül) elutasította, és az csak
ősszel jelent meg a PNAS-ben, az Amerikai Nemzeti Tudományos
Akadémia folyóiratában. A programozott genomszerkesztő rendszer
működését emlőssejtekben Zhangék demonstrálták 2013-ban (Cong et al.
2013). Azóta a módszer – tekintettel arra, hogy viszonylag olcsó és
egyszerű – futótűzként terjedt el a világon, felhasználták már
számos növény- és állatfaj célzott genetikai módosítására, és
2015-ben kínai kutatók emberi embriókon is kipróbálták (Liang et
al., 2015). Jelenleg kereskedelmi forgalomban 65 dollárért
vásárolhatók rendelésre készült vezető-RNS-ek, amelyek elvben az
emberi genom bármely pontjának módosítására alkalmasak. A humán
alkalmazás legfőbb korlátja az, hogy a nukleáz nem teljesen
specifikus, azaz a genom megcélzott egyetlen pontja mellett, jóval
kisebb gyakorisággal, máshol is előidéz mutációkat. Ez növényi vagy
állati alkalmazásnál nem jelent különösebb gondot, de embernél
megengedhetetlen. E problémára kínál megoldást Zhangék legfrissebb
eredménye, egy új, cpf1 nevű, a cas9-nél precízebben,
specifikusabban működő endonukleáz felfedezése (Zetsche et al.,
2015).
Ezt a cikket elsősorban Zhang érdemei méltatásának
szenteltem, mert a tudománytörténetben példátlan eseménynek tartom,
hogy egy fiatal (jelenleg 34 éves) experimentális kutatónak két
teljesen különböző, de egyaránt világraszóló elméleti és gyakorlati
jelentőségű felfedezés létrejöttében is döntő szerepe legyen.
Befejezésül azonban érdemes kitérni arra is, hogy a
CRISPR-cas9-sztoriról nemrégen Eric Lander közzétett egy hosszabb
tanulmányt a Cell című folyóirat Perspektívák rovatában, amelynek
végén néhány általános tanulságot foglalt össze, ezeket talán
érdemes a magyar olvasóval is megismertetni (Lander, 2016).
Az első egy közhely, amelyet minden alapkutatással
foglalkozó kutató tud és vall (csak a tudományfinanszírozásért
felelős politikusok nem). Ez úgy szól, hogy a legnagyobb gyakorlati
jelentőségű felfedezések szinte soha nem úgy születnek, hogy a
megvalósítandó célt keresik tudatosan a kutatók, többnyire egész más
irányú, olykor gyakorlatilag teljesen érdektelen megfigyelésekből,
eredményekből, csak az ismeretszerzésre irányuló kutatásokból indul
el a fontos, gyakorlatban is hasznosítható felfedezéshez vezető út.
A második tanulság a magyar kutatók számára egyáltalán nem evidens,
de ha igaz, akkor jó hír. Ez pedig: a fontos felfedezéshez vezető
úton nemcsak a leggazdagabb országok világhírű műhelyei, hanem kis
országok és kis kutatóhelyek kutatói is tehetnek, és tettek is
fontos, olykor döntő lépéseket (például az alicantei Mojica, az
oszakai Ishino, Philippe Horvath a Danisconál, vagy a vilniusi
Siksnys).
Végül a harmadik – igen szomorú – tanulság, hogy
milyen sok fontos kéziratot utasítottak el a legnagyobb presztízsű
folyóiratok (Nature, Science, Cell) – többnyire azonnal, bírálónak
ki sem küldve azokat –, ezzel súlyosan torzítva a szabadalmi és
karrierszempontból döntő jelentőségű prioritási viszonyokat.
Kulcsszavak: optogenetika, CRISPR-cas9, Nobel-díj,
csatornarodopszin, guide-RNS, genomszerkesztés, endonukleáz
IRODALOM
Barrangou, Rodolphe et al. (2007): CRISPR
Provides Acquired Resistance Against Viruses in Prokaryotes.
Science. 315, 1709–1712. DOI: 10.1126/science.1138140 •
WEBCÍM
Boyden, Edward S. et al. (2005):
Millisecond-timescale Genetically Targeted Optical Control of Neural
Activity. Nature Neuroscience. 8, 1263–1268. DOI: 10.1038/nn1525
Cong, Le et al. (2013): Multiplex Genome
Engineering Using CRISPR/Cas Systems. Science. 339, 819–823. DOI:
10.1126/science.1231143 •
WEBCÍM
Deltcheva, Elitza et al. (2011): CRISPR RNA Maturation by
Trans-encoded Small RNA and Host Factor RNase III. Nature. 471,
602-607. DOI: 10.1038/nature09886
Ishino, Yoshizumi et al. (1987):
Nucleotide Sequence of the Iap Gene, Responsible for Alkaline
Phosphatase Isozyme Conversion in Escherichia coli, and
Identification of the Gene Product. Journal of Bacteriology. 169,
5429–5433. •
WEBCÍM
Jinek, Martin et al. (2012): A
Programmable Dual-RNA-guided DNA Endonuclease in Adaptive Bacterial
Immunity. Science. 337, 816–821. DOI: 10.1126/science.1225829 •
WEBCÍM
Lander, Eric S. (2016): The Heroes of
CRISPR. Cell. 164, 18–28. DOI: 10.1016/j.cell.2015.12.041 •
WEBCÍM
Liang, Puping et al. (2015):
CRISPR/Cas9-mediated Gene Editing in Human Tripronuclear Zygotes.
Protein & Cell. 6, 363–372. DOI: 10. 1007/s13238-015-0153-5 •
WEBCÍM
Mojica, F. J. M. et al. (1995): Long
Stretches of Short Tandem Repeats Are Present in the Largest
Replicons of the Archaea Haloferax mediterranei and Haloferax
volcanii and Could Be Involved in Replicon Partitioning. Molecular
Microbiology. 36, 244–248. DOI: 10.1111/j.1365-2958.1995.mmi_
17010085.x •
WEBCÍM
Nagel, Georg et al. (2003):
Channelrhodopsin-2, a Directly Light-gated Cation-selective Membrane
Channel. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA.
100, 13940–13945. DOI: 10.1073 pnas.193619210 •
WEBCÍM
Nagel, Georg et al. (2005): Light
Activation of Channelrhodopsin-2 in Excitable Cells of
Caenorhabditis elegans Triggers Rapid Behavioral Responses. Current
Biology. 15, 2279–2284.
Pourcel, Christine – Savignol, G. – Vergnaud, G. (2005): CRISPR
Elements in Yersinia pestis Acquire New Repeats by Preferential
Uptake of Bacteriophage DNA, and Provide Additional Tools for
Evolutionary Studies. Microbiology. 151, 658–663. DOI:
10.1099/mic.0.27437-0 •
WEBCÍM
Zemelman, Boris V. et al. (2003):
Photochemical Gating of Heterologous Ion Channels: Remote Control
over Genetically Designated Populations of Neurons. Proceedings of
the National Academy of Sciences of the USA. 100, 1352–1357. DOI:
10.1073/pnas.242738899 •
WEBCÍM
Zetsche, Bernd et al. (2015): Cpf1 is a
Single RNA-guided Endonuclease of a Class2 CRISPR-Cas System. Cell.
163, 759–771. DOI: 10.1016/j.cell.2015. 09.038 •
WEBCÍM
|
|